Фото: Jenna Luecke | Университет Техаса
Согласно новому исследованию, проведенному исследователями Консорциума моделирования COVID-19 из Техасского университета в Остине, особозаразный штамм SARS-CoV-2 появился в США еще в октябре 2020 года. Однако, ученые впервые обнаружили его в начале декабря в Соединенном Королевстве, где, как считается, возник этот очень заразный и более смертоносный вариант.
Журнал Emerging Infectious Diseases, который опубликовал раннюю версию исследования, предоставляет доказательства того, что вариант коронавируса B117 (501Y) распространился за несколько месяцев по всему миру незамеченным еще до того как ученые его обнаружили.
«К тому времени, когда мы узнали о британском штамме в декабре, он уже тихо распространился по всему миру», - сказала Лорен Ансель Мейерс, директор Консорциума моделирования COVID-19 в Техасском университете в Остине и профессор интегративной биологии. «По нашим оценкам, вариант B117, вероятно, прибыл в США к октябрю 2020 года, за два месяца до того, как мы узнали о его существовании».
Проанализировав данные по 15 странам, исследователи оценили вероятность того, что путешественники из Великобритании ввезли штамм в 15 странах в период с 22 сентября по 7 декабря 2020 г. Они обнаружили, что данный штамм вируса почти наверняка прибыл во все 15 стран к середине ноября. В США штамм, вероятно, прибыл к середине октября.
«Это исследование подчеркивает важность лабораторного надзора», - сказал Мейерс. «Быстрое и тщательное секвенирование образцов вирусов имеет решающее значение для раннего обнаружения и отслеживания новых вызывающих озабоченность вариантов».
Фото: Консорциум моделирования COVID-19 Университета Техаса
В связи с публикацией документа члены консорциума разработали новый калькулятор, который можно использовать при планировании генетического секвенирования. Калькулятор помогает обнаруживать наличие штаммов. Чтобы помочь расширить национальный надзор за штаммами, новый онлайн-калькулятор указывает количество образцов вируса, которые необходимо секвенировать, для того чтобы найти новые варианты при их первом появлении. Например, если цель состоит в том, чтобы обнаружить появляющийся вариант к тому времени, когда он вызывает 1 из каждых 1000 новых случаев заражения COVID-19, необходимо секвенировать примерно 3000 образцов, положительных на SARS-CoV-2 в неделю.
«Наш новый калькулятор определяет, сколько положительных образцов SARS-CoV-2 необходимо секвенировать, чтобы гарантировать обнаружение новых угроз, как только они начнут распространяться», - сказал Спенсер Вуди, научный сотрудник Консорциума моделирования COVID-19.
Он пояснил, что у калькулятора есть вторая функция. Он также помогает лабораториям выяснить, насколько быстро они обнаружат новые варианты, учитывая их текущую способность к секвенированию.
«Мы создали этот инструмент для поддержки федеральных, государственных и местных органов здравоохранения в создании надежных систем раннего предупреждения об этой и будущих угрозах пандемии», - сказал Мейерс.
Источник: SciTechDaily
Перевод: Айнур Искакова
